Vor allem Quellen zur Geschichte und zu den wissenschaftlichen Leistungen der Abteilung, sowie zu verschiedenen Forschungen und Unternehmungen seiner Mitglieder und anderer Altertumsforscher. Heute wird es in die Bestandsgruppen Altregistratur/Institutsakten, Zeichnungs- und Planarchiv, Kartensammlung, Luftbildarchiv, Positivsammlung, Nachlässe und Grabungs- bzw. Projektarchive unterteilt. Die Bestände werden nach den aktuell geltenden internationalen Standards aufbewahrt, erschlossen und digitalisiert, sodass sie für die Zukunft gesichert bleiben und der Forschung bereitgestellt werden können.