Seit 1833 befindet sich die Zentrale des Deutschen Archäologischen Instituts in Berlin. Hier sind der Präsidialbereich und die Zentralverwaltung angesiedelt. Das Profil der wissenschaftlichen Abteilung der Zentrale ist durch Querschnitts-referate zur historischen Bauforschung, den Naturwissenschaften, der wissenschaftlichen IT sowie des Kulturerhalts und Site Managements geprägt. Hinzu kommen abteilungsübergreifende Dienstleistungen für die Forschungsinfrastruktur.