Die Archive der Außenstelle Baghdad werden in der Orient-Abteilung in Berlin verwahrt und von den dortigen Mitarbeiter:innen betreut.

Im Bestand befindet sich vor allem die Dokumentation der eigenen Ausgrabungsprojekte (siehe Projekte der Orient-Abteilung). Wissenschaftlernachlässe von Walter Andrae (Teilbestand), Walter Bachmann, Helmut Bohtz, Arnold Nöldeke, Heinrich Lenzen beinhalten Materialen zu den Forschungen im Irak.