Im Fokus des Referates Organisation steht die Steuerung des Personalhaushalts. Dazu gehört es, den Personalbedarf zu planen sowie Personalmittel zu budgetieren und zu bewirtschaften. Ein weiteres wichtiges Arbeitsfeld ist die Aufbau- und Ablauforganisation sowie die Verwaltungsmodernisierung, insbesondere hinsichtlich der Digitalisierung. Für die Optimierung des Ressourceneinsatzes führt es Organisationsuntersuchungen mit Ist-Analysen, Aufgabenkritik, Optimierung, ggf. Überführung der Prozesse in die digitale Verwaltungswelt durch.

Das Referat Organisation berät die Leitungen der Organisationseinheiten in allen organisatorischen Angelegenheiten und versteht sich gegenüber allen Mitarbeitenden als dienstleistungsorientiert, beratend und unterstützend in allen Belangen des Organisationsbereichs und -rechts. Dabei  arbeitet es eng mit dem Referat Finanzen, dem Referat Personal und Besoldung und dem IT-Referat der ZWD zusammen.