An insgesamt 16 Standorten unterhält das DAI Fachbibliotheken mit nahezu einer Million Bände. Sie stehen Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern aus aller Welt offen. Entsprechend dem Forschungsauftrag der Zweigstellen haben die Bibliotheken regionale und disziplinäre Sammelschwerpunkte und stellen als einmalige Labore geisteswissenschaftlicher Forschung jeweils eine optimale Forschungsumgebung zur Verfügung. Durch Kauf, Tausch und Schenkungen werden die Bestände der Bibliotheken ebenso wie das Angebot an elektronischen Ressourcen ständig erweitert. Die Bestände sind im gemeinsamen DAI-Verbund-Katalog iDAI.bibliography/ZENON nachgewiesen, in den auch die Bibliographien zur Klassischen Archäologie und zur Vor- und Frühgeschichte integriert sind.